INT J LAB HEMATOL:通过双色荧光实时PCR同时检测白血病中的45个融合基因

2017-04-20 MedSci MedSci原创

研究人员开发了一种新型双色TaqMan探针实时PCR方法,可同时在12个平行反应中筛选45个融合转录本。该方法用携带已知融合转录物和患者样品的细胞系进行测试和验证。

近日,国际杂志INT J LAB HEMATOL上在线发表一篇关于通过双色荧光实时PCR同时检测白血病中的45个融合基因的研究。

复发性遗传异常的检测对于白血病预后的精确诊断和评估具有重要意义。然而传统的嵌套逆转录PCR费时费力。

研究人员开发了一种新型双色TaqMan探针实时PCR方法,可同时在12个平行反应中筛选45个融合转录本。该方法用携带已知融合转录物和患者样品的细胞系进行测试和验证。

研究人员成功开发了用于快速检测45个融合基因,并验证了15种更常见的融合基因的多重实时PCR方法。批内最频繁重排的测定重现性在循环阈值(Ct)的变异系数(CV)为0.41%至0.74%,并且在5个单独实验中的批次间重现性范围为1.62%至2.83%。测试的易位检测限最低在116 000132 000之间。对213例患者样本的验证显示出100%的特异性,且与常规巢式RT-PCR一致性较高。

总的来说,研究认为,这种方法易于应用,成本效益好,临床上可用于在白血病初期诊断阶段快速筛选融合基因。其使用也可以扩展到监测微小残留疾病。

原始出处:

Z. Zheng, P. Zhang, G. He, K. et.al. Simultaneous detection of 45 fusion genes in leukemia by dual-color fluorescence real-time PCR (pages 175–184): 30 JAN 2017 | DOI: 10.1111/ijlh.12600

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