Arthritis Rheumatol：全基因组关联分析揭示干燥综合征的遗传异质性
2017-06-09 xiangting MedSci原创
根据种族不同SS的遗传关联有显著差异，但这并不能通过亚表型的差异来解释。
干燥综合征的国际协作临床联盟（SICCA）是一个对参与者进行多点观察的国际数据登记和生物指导组织，在Omni2.5M平台对参与者进行基因分型和使用常规的方案指导方法进行了深入的表型分析。这项研究的目的是探讨干燥综合征（SS）在不同种族和疾病亚型中的遗传病因学。
使用SICCA参与者和从dbGaP数据集获得的外部对照进行全基因组关联研究分析，一个使用所有参与者（1,405例患者，1,622 例SICCA对照和3,125例外部对照），一个使用欧洲参与者（分别为585,966和580例），一个使用亚洲参与者（分别为460,224和901例），通过主成分分析进行种族调整。此外还研究了亚型分布是否因种族不同而不同，以及这是否会导致遗传关联的异质性。
在主要组织相容性复合体（MHC），IRF5和STAT4（分别为：P=3×10-42，P= 3×10-14，P ?= 9×10-10）的确定区域观察到显著相关性，以及几个新的区域（2个或更多的关联P <1×10-5）。之前曾涉及自身免疫性疾病的两个区域：KLRG1（P= 6×10 -7 [亚洲人]）和SH2D2A（P = 2×10-6 [所有参与者]）。发现欧洲人和亚洲人关联之间的巨大差异，尤其是在MHC中具有高异质性。在已知和潜在区域的代表性单核苷酸多态性在研究人群中的等位基因频率具有非常显著的差异。SSA / SSB自身抗体产生和阴唇唾液腺聚焦评分标准与第一个世界主要成分相关，表明非欧洲祖先（ P ?= 4×10 -15，P ?= 4×10 -5） ），但是亚型差异并没有解释遗传关系中祖先的大部分差异。来自已建立和提示区域的代表性单核苷酸多态性在研究人群中的等位基因频率具有非常显着的差异。我们显示，SSA / SSB自身抗体产生和唾液腺聚焦评分标准与第一个世界范围主要成分相关，表明非欧洲祖先（ P = 4×10 -15，P = 4×10 -5 ），但是亚型差异并没有解释遗传关系中大部分的祖先差异。
根据种族不同SS的遗传关联有显著差异，但这并不能通过亚表型的差异来解释。
原始出处：
Kimberly E. Taylor，et al. Genome-Wide Association Analysis Reveals Genetic Heterogeneity of Sjogren's Syndrome According to Ancestry. Arthritis Rheumatol. June 2017.
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作者：xiangting
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