肝细胞癌（HCC）是全球第六大最常见癌症，也是第四大最常见的癌症相关死亡原因。病毒性肝炎是肝癌的常见原因，而我国恰恰是肝炎大国，我国有很高的肝癌负担。虽然现在很多研究都集中在肝癌的致病基因特征，但是，中国HCC患者的遗传图谱尚未有充分研究。
本研究旨在解析中国HCC患者的遗传特征。
共招募了165位HCC患者，包括146位男性和19位女性。中位年龄为55岁（范围 27-78岁）。同时采集了患者的相应的临床和病理信息。共收集了168份肿瘤组织以进行二代测序（NGS），涵盖450个基因。检测的变异包括单核苷酸变异（SNV）、小片段和长片段插入和缺失（InDels）、拷贝数变异和基因重组。此外，还分析了肿瘤突变负荷（TMB），最高四分位的HCC被划分为高TMB。
突变图谱
在168份HCC组织中的258个基因中共检测出了1004个遗传变异。确定了160份HCC样本的TMB值，中位TMB值为5.4 Muts/Mb（范围 0-28.4 Muts/Mb），75% TMB线为7.7 Muts/Mb。最常见的突变基因有TP53、TERT、CTNNB1、AXIN1、RB1、TSC2、CCND1、ARID1A和FGF19。SNV是最常见的突变类型，G:C>T:A和鸟嘌呤转化是最常见的SNV。
与野生型患者相比，携带TP53突变的患者中Edmondson III-IV级和微血管浸润的比例明显较高（p<0.05）。在TERT突变的患者中，肿瘤侵犯肝包膜的比例明显更高（p<0.05）。在CTNNB1突变患者中，Edmondson I-II级、甲胎蛋白(AFP) <25 μmg/L和无乙肝病史的比例显著升高（p<0.05）。CTNNB1突变与高TMB相关（p<0.05）。
相关分析显示，TP53突变与微血管侵袭（p=0.002, OR=3.096)和Edmondson III-IV级独立相关（p=0.008, OR=2.613)。TERT突变与肝包膜肿瘤浸润独立相关（p=0.001, OR=3.030)。CTNNB1突变与AFP独立相关(<25 μmg/L) (p=0.009, OR=3.414)。
综上所述，中国HCC患者最常见的突变基因有TP53、TERT和CTNNB1，这些基因可能通过调节TP53通路、Wnt信号通路和端粒修复通路导致HCC的发生发展。而且，携带不同基因突变的患者往往有不同的临床特征。
原始出处：
Wang Shuo,Shi Huasheng,Liu Tao et al. Mutation profile and its correlation with clinicopathology in Chinese hepatocellular carcinoma patients. Hepatobiliary Surg Nutr, 2021, 10: 172-179.
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