Front Med:探讨益康汤治疗多囊卵巢综合征的机制:GEO数据集、网络药理学和分子动力学模拟的整合
2024-10-20 紫菀款冬 MedSci原创
该研究系统探讨了YKD治疗PCOS的多靶点机制,并通过分子对接和MD进行了初步验证,为YKD治疗PCOS的疗效提供了有力证据。
背景:多囊卵巢综合征(PCOS)是影响育龄妇女的常见疾病,发病率呈逐年上升趋势。目前,PCOS的治疗主要强调通过运动、饮食改变、促排卵药物和辅助生殖技术来缓解症状。但挑战仍然存在,包括治疗时间延长、多种并发症和不太理想的治疗结果。
益康汤(YKD)是由温州瓯越名医孙云创立的经验方,该配方由紫草、柴胡、茜草、丹参、牡丹皮、枇杷叶、龙胆、川牛膝、醋香附、山药、栀子、葛根、菟丝子等13种草药组成,以其清热、活血、化瘀、通脉的功效而闻名。前期研究发现,YKD能有效改善PCOS患者的激素水平和临床症状。然而,由于其复杂的化学性质,该方的确切生物分子药理作用尚不清楚。
目的:通过GEO数据集、网络药理学和动态模拟相结合的方法,探讨益康汤(YKD)治疗PCOS的机制。
方法:从中药系统药理学(TCMSP)平台上收集YKD的有效成分及其靶点。从GeneCards、OMIM、PharmGKB、DrugBank和GEO等多个数据库检索PCOS的疾病相关靶点。利用基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,确定了与YKD和PCOS之间重叠靶点相关的潜在途径。通过分子对接和分子动力学模拟(MD)进一步探索核心靶点与组分之间相互作用的机制。
结果:鉴定出YKD的潜在有效成分139个,靶点315个。对PPI网络的拓扑分析揭示了10个核心目标。这些靶点主要参与调控生物过程,包括细胞代谢、细胞凋亡和细胞增殖。与PCOS治疗相关的信号通路包括PI3K-Akt信号通路、脂质和动脉粥样硬化信号通路、MAPK信号通路和内分泌抵抗信号通路。此外,分子对接和MD已经显示出活性化合物与筛选靶点之间良好的结合能力。
结论:该研究系统探讨了YKD治疗PCOS的多靶点机制,并通过分子对接和MD进行了初步验证,为YKD治疗PCOS的疗效提供了有力证据。
原始出处:
Miao J, Gao L, Liu X, et al. Exploring the therapeutic mechanisms of Yikang decoction in polycystic ovary syndrome: an integration of GEO datasets, network pharmacology, and molecular dynamics simulations. Front Med (Lausanne). 2024;11:1455964. Published 2024 Oct 3. doi:10.3389/fmed.2024.1455964
作者:紫菀款冬
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