Eur Urol Focus:转移性前列腺癌患者液体活检样本和肿瘤组织的二代测序可行性如何?

2024-04-22 AlexYang MedSci原创

研究人员在前列腺癌患者中,分析了液体活检和肿瘤组织样本进行二代测序(NGS)的可行性和可比性。结果发现,液体活检 NGS 的 BRCA1/2 基因变异检出率更高。

过去十年中,由于针对转移性激素敏感性前列腺癌(mHSPC)和去势抵抗性前列腺癌(mCRPC)的各种系统性药物获得批准,转移性前列腺癌(mPC)的治疗格局发生了明显地变化。最近,根据两项三期随机试验(PROfound,NCT02987543;PROpel,NCT03732820)的结果,欧洲药品管理局(EMA)批准了用于mCRPC的PARP抑制剂。在这些试验中,BRCA1/2 和 ATM 等同源重组修复 (HRR) 基因发生变异的患者对 PARP 抑制剂特别敏感,中位无进展生存期更长可以证明这一点。随着欧洲药品管理局(European Medicines Agency)批准 PARP 抑制剂用于转移性去势抵抗性前列腺癌,以及正在进行的转移性激素敏感性前列腺癌试验,检测 BRCA1/2 和其他同源重组修复基因的遗传变异已变得越来越重要。

近期,来自德国法兰克福大学医院的研究人员在Eur Urol Focus上发表文章,他们的目的是研究在实际临床环境中,对液体活检(LB;循环肿瘤 DNA)和肿瘤组织(TT)样本进行二代测序(NGS)的可行性和可比性

研究队列由 50 名转移性前列腺癌(mPC)患者组成,他们的 TT NGS 检测了 BRCA1/2 基因变异,并同意进行额外的 LB NGS 检测。TT NGS 采用 Oncomine Comprehensive Assay v3(赛默飞世尔科技公司,美国马萨诸塞州沃尔瑟姆)技术。LB NGS 则采用 Guardant360 83 基因检测(Guardant Health, Palo Alto, CA, USA),包括所有类型的体细胞变异、微卫星不稳定性和血液肿瘤突变负荷。研究人员计算了 BRCA1/2 变异率以及 TT 和 LB 结果之间的负百分比一致率 (NPA) 和正百分比一致率 (PPA)。

研究结果发现,44/50 例患者(88%)成功进行了 TT NGS,其中 4 例(9%)检测到致病性 BRCA1/2 基因改变。所有 50 例患者(100%)都成功进行了 LB NGS,其中 10 例(20%)检测到 BRCA1/2 基因改变。在对 44 例成功进行 TT NGS 的患者进行的亚组分析中,NPA 为 85%,PPA 为 50%。从采集 TT 样本到采血进行 NGS 的中位时间为 132 周(IQR 94-186)。研究的局限性在于样本量有限和 NGS 评估时间的差异。

44 例患者 TT 和 LB NGS 检测 BRCA2 和/或 BRCA1 变异的一致性情况

综上所述,与传统的 TT NGS 相比,LB NGS 的 BRCA1/2 基因变异检出率更高(20% 对 9%)。理想情况下,BRCA1/2 检测应基于这两种方法,以确定所有符合 PARP 抑制剂治疗条件的 mPC 患者

原始出处:

Philipp Mandel,Benedikt Hoeh,Clara Humke et al. Feasibility of Next-generation Sequencing of Liquid Biopsy (Circulating Tumor DNA) Samples and Tumor Tissue from Patients with Metastatic Prostate Cancer in a Real-world Clinical Setting in Germany. Eur Urol Focus. Mar 2024

作者:AlexYang



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