Oncogene：肾移植患者BK多瘤病毒相关尿道肿瘤的病毒整合情况研究
2020-08-17 AlexYang MedSci原创
移植后与BK多瘤病毒（BKPyV）相关的癌症已经引起了越来越多的注意。然而，BKPyV与致瘤过程的整合作用仍旧不清楚。
移植后与BK多瘤病毒（BKPyV）相关的癌症已经引起了越来越多的注意。然而，BKPyV与致瘤过程的整合作用仍旧不清楚。
最近，有研究人员在3名BKPyV相关的尿路上皮肿瘤患者中，进行了原发性肿瘤和转移性肿瘤的二代病毒组捕获测序。结果发现，在6例肿瘤中鉴定了332个病毒整合位点。在原发性和转移性肿瘤中，BKPyV的整合主要遵循了微同源介导的末端连接机制，理由是在84%的整合位点的侧边区域，人类和BKPyV基因组的微同源显著富集。另外，病毒DNA断点是非随机的，并倾向于在大T基因、小T基因和病毒蛋白2基因中聚集。在原发和转移性肿瘤之间有3、1和1个一致的整合位点，分别影响着LINC01924、eIF3c和NEIL2基因。
BKPyV病毒整合位点分布和相关支持性的reads
原发肿瘤和转移性肿瘤的一致性整合位点
最后，研究人员认为BKPyV的整合在原发性和转移性肿瘤中是一个持续的过程，并能够产生异质性性肿瘤细胞群体。通过该持续的过程，某种细胞群体获得了伸张优势或者是转移的潜力，这也是病毒整合的结果（影响病毒整个的细胞基因或者改变病毒基因的表达或者功能）。
原始出处：
Yuchen Wang， Yanna Liu， Wenfeng Deng et al. Viral integration in BK polyomavirus-associated urothelial carcinoma in renal transplant recipients： multistage carcinogenesis revealed by next-generation virome capture sequencing. Oncogene. 28 July 2020
作者：AlexYang
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