Nat Commun:中美合作获得人类脂肪中丰富的lncRNAs资源库
2018-04-18 BioArt BioArt
棕色脂肪和白色脂肪细胞有着明显的形态学区别，它们的生物学功能也大不相同。棕色脂肪组织在全身的能量代谢调控中起着重要的作用，它可以“燃烧”掉多余的能量从而减少体内以脂肪形式堆积的能量。过去的观点认为，棕色脂肪组织在啮齿类动物的一生中一直存在，而人的肩胛区的棕色脂肪只存在于幼年阶段，并随着我们的成长而退化，所以以前的观点认为成年人体内没有棕色脂肪组织。但新近利用成像技术的研究表明，成年人在颈－锁骨区域
棕色脂肪和白色脂肪细胞有着明显的形态学区别，它们的生物学功能也大不相同。棕色脂肪组织在全身的能量代谢调控中起着重要的作用，它可以“燃烧”掉多余的能量从而减少体内以脂肪形式堆积的能量。过去的观点认为，棕色脂肪组织在啮齿类动物的一生中一直存在，而人的肩胛区的棕色脂肪只存在于幼年阶段，并随着我们的成长而退化，所以以前的观点认为成年人体内没有棕色脂肪组织。但新近利用成像技术的研究表明，成年人在颈－锁骨区域有相当数量的Ucp1阳性的脂肪细胞，其活性与BMI呈负相关，而与基础代谢速率呈正相关。
过去的研究分离并鉴定了多个棕色脂肪组织发育的蛋白调控因子，而近期的高通量测序中获得的新证据显示，大量的长非编码RNAs(lncRNAs)在脂肪发育过程中被严格调控。尽管缺乏蛋白质编码能力，但lncRNAs在脂肪发育和代谢过程中仍行使重要功能。杜克-新加坡国立大学医学院的孙磊团队及其他多个团队的早期研究已经揭示了一组对小鼠棕色脂肪发育必不可少的lncRNAs 如lncBATE1、lncBATE10 和 Blnc1。最近孙磊团队又在小鼠中发现了一个对leptin有调控作用的lncRNA (lnc-Leptin)。但由于大多数lncRNA在小鼠和人之间的保守性较差，人的脂肪样本采集困难，因此至今缺乏完整的人的脂肪的lncRNA目录，特别是在棕色脂肪中，阻碍了我们对人体脂肪中lncRNA的理解。
Nature Communications 杂志上发表了题为 De novo reconstruction of human adipose transcriptome reveals conserved lncRNAs as regulators of brown adipogenesis 的研究论文。对人类胎儿棕色脂肪、成人内脏和皮下脂肪分别进行了深度RNA测序，构建人类脂肪组织转录序列，共发现了3149个LncRNAs，其中318个是人和小鼠之间保守的lncRNAs。169种保守的人类lncRNA与其附近的mRNAs呈正相关。同时实验也证实了其中一个保守的lncRNA，lnc-dPrdm16，是棕色脂肪发育所必需的调控因子。该研究工作为今后研究人类脂肪中的lncRNAs提供了一个有价值的资源。
温州医科大学徐聃与杜克-新加坡国立大学医学院孙磊为该论文的共同通讯作者，温州医科大学丁春明为论文的第一作者及并列通讯作者，林艳卿为并列第一作者。
原始出处：
Ding C, Lim YC, Chia SY,et al. De novo reconstruction of human adipose transcriptome reveals conserved lncRNAs as regulators of brown adipogenesis.Nat Commun. 2018 Apr 6;9(1):1329. doi: 10.1038/s41467-018-03754-3.
作者：BioArt
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