Sci Rep:基于LC-MS的肾细胞肿瘤组织学亚型代谢组学分析
2019-11-14 AlexYang MedSci原创
肾细胞肿瘤(RCC)是根据他们的组织学特性进行分类的。RCC准确的分类和代谢异常的综合理解具有非常重要的意义。最近,有研究人员调查了使用代谢组学分析对主要的RCC亚型进行分类情况,并描述了每一种亚型的代谢变异情况。研究人员使用液相色谱-质谱法对65个RCC冷冻样本进行了代谢组学分析(40个透明细胞癌,14个乳头状癌和11个嫌色性细胞癌)。基于代谢组数据的OPLS-DA多变量分析表明了3种RCC主要
肾细胞肿瘤(RCC)是根据他们的组织学特性进行分类的。RCC准确的分类和代谢异常的综合理解具有非常重要的意义。
最近,有研究人员调查了使用代谢组学分析对主要的RCC亚型进行分类情况,并描述了每一种亚型的代谢变异情况。研究人员使用液相色谱-质谱法对65个RCC冷冻样本进行了代谢组学分析(40个透明细胞癌,14个乳头状癌和11个嫌色性细胞癌)。基于代谢组数据的OPLS-DA多变量分析表明了3种RCC主要亚型明显的区别(R2=75.0%, Q2=59.7%)。研究人员通过一个独立的群体对预后表现进行了评估,透明细胞癌,乳头状细胞癌和嫌色性细胞癌的AUROC分别为0.924, 0.991和1。21种顶级代谢物的进一步途径分析表明氨基酸和脂肪酸代谢在3种RCC亚型之间存在显著差异。
原始出处:
Lun Jing, Jean-Marie Guigonis, Delphine Borchiellini et al. LC-MS based metabolomic profiling for renal cell carcinoma histologic subtypes. Sci Rep. 30 Oct 2019
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