Mol Med Rep：通过生物信息学方法对鼻炎分子机制的探索

2017-12-28 AlexYang MedSci原创

鼻炎生物信息学基因表达表达网络

最近，有研究人员分析了基因表达情况来探索差异化表达的基因（DEGs）在鼻炎发病机理中的功能和调控网络，利用的是生物信息学方法。研究人员从基因表达综合数据库中下载了GSE43523基因的表达数据。研究人员的数据集包括了7个季节性鼻炎案例和5个非过敏性正常案例，并通过R limma包分析了鼻炎样本和正常样本之间的DEGs情况。WebGestal数据库用来鉴定DEGs的KEGG信号通路，并利用R中的DC

最近，有研究人员分析了基因表达情况来探索差异化表达的基因（DEGs）在鼻炎发病机理中的功能和调控网络，利用的是生物信息学方法。研究人员从基因表达综合数据库中下载了GSE43523基因的表达数据。研究人员的数据集包括了7个季节性鼻炎案例和5个非过敏性正常案例，并通过R limma包分析了鼻炎样本和正常样本之间的DEGs情况。WebGestal数据库用来鉴定DEGs的KEGG信号通路，并利用R中的DCGL包鉴定了DEGs不同对的差异化共表达，并且根据这些对构建了差异化的共表达网络。另外，研究人员还根据检索交互基因数据库检索工具构建了DEGs的蛋白互作（PPI）网络。研究人员在鼻炎样本和正常样本之间共鉴定了263个DEGs，包括了125个下调和138个上调基因。这些DEGs富集在7个KEGG信号通路中，并且获得了308个差异化共表达基因对，还构建了差异化的共表达网络，包括了212个节点。另外，研究人员共鉴定了148 个DEGs PPI对，并且根据这些对构建了PPI网络。最后，研究人员指出，生物信息学方法能够帮助人们鉴定与鼻炎病理相关的明显的基因和信号通路。类固醇生物合成途径和代谢途径也许在过

作者：AlexYang



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