Sci Rep：研究确定卵巢癌中差异表达的LncRNA
2017-09-08 MedSci MedSci原创
癌相关成纤维细胞（CAFs）与卵巢癌预后较差相关。与肿瘤细胞不同，CAFsDNA突变很罕见，增加了其他调节基因（如长非编码RNAs的可能性（lncRNAs））表达机制的可能性。本研究旨在确定促进CAFs的肿瘤促进表型的lncRNA。研究共纳入了67个卵巢CAF标本和10个正常卵巢细胞（NOF）样本进行RNA表达分析，以识别差异表达的lncRNA，并构建功能网络以预测参与转移CAF特异性lncRNA
癌相关成纤维细胞（CAFs）与卵巢癌预后较差相关。与肿瘤细胞不同，CAFsDNA突变很罕见，增加了其他调节基因（如长非编码RNAs的可能性（lncRNAs））表达机制的可能性。本研究旨在确定促进CAFs的肿瘤促进表型的lncRNA。
研究共纳入了67个卵巢CAF标本和10个正常卵巢细胞（NOF）样本进行RNA表达分析，以识别差异表达的lncRNA，并构建功能网络以预测参与转移CAF特异性lncRNAs。
基因表达芯片共检测出1970个可供分析的lncRNAs，其中39个特异性lncRNAs在CAF与NOFS中差异表达。使用多变量模型评估鉴别差异表达lncRNA的预测能力。已知的转录因子相互作用，转录因子基因相互作用，以及构建一个上下游特定的相互作用网络来确定多种lncRNAs可能在转移中发挥重要作用。
总之，该研究发现了卵巢癌中差异表达的lncRNAs，并可有助于预测CAF转移促进表型。
原始出处：
Fatemeh Vafaee, Emily K. Colvin, et al. Functional prediction of long non-coding RNAs in ovarian cancer-associated fibroblasts indicate a potential role in metastasis.Sci Rep. 2017; 7: 10374. Published online 2017 Sep 4. doi: 10.1038/s41598-017-10869-y
作者：MedSci
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