Clin Cancer Res:预测人类口腔癌侵略性的基因签名
2014-08-25 佚名 生物谷
华盛顿大学医学院研究人员通过研究小鼠口腔癌,研究人员已经找到一种方法来,预测人类中类似肿瘤的攻击性,这对诊断测试、指导治疗有重要意义。所有晚期口腔癌患者都接受类似的治疗,耳鼻喉科副教授Ravindra Uppaluri博士说:有些接受手术,放疗和化疗治疗后效果好,但有些病人没有得到很好的治疗效益。我们感兴趣的是找出其中原因。 在Clinical Cancer Research杂志上的报告中,研
华盛顿大学医学院研究人员通过研究小鼠口腔癌,研究人员已经找到一种方法来,预测人类中类似肿瘤的攻击性,这对诊断测试、指导治疗有重要意义。所有晚期口腔癌患者都接受类似的治疗,耳鼻喉科副教授Ravindra Uppaluri博士说:有些接受手术,放疗和化疗治疗后效果好,但有些病人没有得到很好的治疗效益。我们感兴趣的是找出其中原因。
在Clinical Cancer Research杂志上的报告中,研究人员发现对于癌症扩散相关的基因表达,人类口腔癌与小鼠口腔癌中有着一致的表达模式。分析人类口腔癌样本的基因数据,他们也发现了与癌症积极扩散相关的基因标记。在新研究中,不是用基因方法来诱发小鼠肿瘤,研究小组反复涂抹一种已知的致癌物质,以与人类发生口腔癌大致相同的方式,来诱发小鼠癌症。
口腔癌病人往往有烟草和酒精的使用,烟草和酒精的使用会推动这些肿瘤的发展,Uppaluri说:我们认为小鼠暴露于致癌物将更有可能产生与人类相似种类的肿瘤。研究人员,表明暴露于致癌物质下,小鼠有时发生的肿瘤没有蔓延,但有时会有激进的转移性肿瘤。Uppaluri团队试图找出小鼠肿瘤和人类肿瘤中是否存在相似的基因。他们将小鼠肿瘤序列与癌症基因组图谱(TCGA)中的人数据集进行比较。
当我们测序这些肿瘤,我们发现了很多存在于小鼠肿瘤中的遗传突变,也被发现在人口腔癌中。进一步分析鉴定出在小鼠肿瘤或人肿瘤中,与更积极肿瘤相关的约120个基因表达中的一个共同基因签名。研究人员使用从324患者中采集的数据来证实这个基因签名。随后,利用在华盛顿大学接受治疗的口腔癌患者样本,利用他们的基因签名开发新的测试以确认侵袭性肿瘤,结果发现准确率高达约93%。
原始出处:
Onken MD1, Winkler AE1, Kanchi KL1, Chalivendra V1, Law JH1, Rickert CG1, Kallogjeri D1, Judd NP1, Dunn GP1, Piccirillo JF1, Lewis JS Jr2, Mardis ER2, Uppaluri R3.A surprising cross-species conservation in the genomic landscape of mouse and human oral cancer identifies a transcriptional signature predicting metastatic disease.Clin Cancer Res. 2014 Jun 1;20(11):2873-84. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-14-0205. Epub 2014 Mar 25.
作者:佚名
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