ARD：宏基因组关联研究揭示了日本系统性红斑狼疮患者肠道微生物群的疾病特异性景观
2021-12-28 MedSci原创 MedSci原创
本研究旨在通过全面的宏基因组范围关联研究 (MWAS) 以及相应的综合分析，揭示肠道微生物群与SLE 相关的变化及其与宿主的相互作用。
目的：肠道微生物组的改变与系统性红斑狼疮 (SLE) 的发病机制有关。然而，关于SLE肠道微生物组及其与宿主相互作用的全面视图仍有待揭示。本研究旨在通过全面的宏基因组范围关联研究 (MWAS) 以及相应的综合分析，揭示肠道微生物群与SLE 相关的变化及其与宿主的相互作用。
方法：全宏基因组鸟枪法测序技术与常规16S核糖体RNA测序相比有很多优势，例如更高的分类分辨率和适用于功能分析。研究者基于日本群体（N病例 = 47，N对照 = 203）肠道微生物DNA的鸟枪测序对SLE进行了MWAS。研究者将MWAS的结果与全基因组关联研究 (GWAS) 数据和血浆代谢物数据相结合。
结果: 通过物种水平的系统发育分析，该研究确定并验证了SLE患者中间链球菌和心绞痛链球菌的增加。微生物基因分析显示链球菌衍生基因增加，包括参与氧化还原反应的基因。此外，与硫代谢和鞭毛组装相关的微生物途径在SLE患者中发生了改变。研究者通过比较MWAS和SLE的GWAS（即 MWAS-GWAS 相互作用）结果，确定了宏基因组和种系基因组之间丰富的生物学途径的重叠。α-多样性和β-多样性分析提供了SLE患者宏基因组生态失调的证据。微生物组-代谢组关联分析确定了酰基肉碱与中间链球菌（一种SLE相关分类群）的剂量正相关。
结论：该研究的MWAS以及随后的综合分析揭示了SLE相关的肠道微生物组变化及其与宿主的相互作用，这有助于我们了解微生物组与SLE之间的关系。
出处：
Tomofuji Y, Maeda Y, Oguro-Igashira E, et al. Metagenome-wide association study revealed disease-specific landscape of the gut microbiome of systemic lupus erythematosus in Japanese. Annals of the Rheumatic Diseases 2021;80:1575-1583.
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