Blood：PU.1编码基因所在染色质区域的动态三维结构
2018-10-14 MedSci MedSci原创
中心点：PU.1编码基因的空间染色质结构，在髓系分化过程中动态重构，在AML中被破坏。PU.1自动调节启动空间重构，并招募LDB1来稳定PU.1基因调控DNA元件之间所形成的染色质环。摘要：基因表达的表观遗传调控发生在被称为拓扑关联域(TADs)的离散空间染色体单元内，但大多数基因的精确的空间要求尚未明确；该点对与癌症相关的基因特别有意义。Daniel Schuetzmann等人采用高分辨率的染色
中心点：
PU.1编码基因的空间染色质结构，在髓系分化过程中动态重构，在AML中被破坏。
PU.1自动调节启动空间重构，并招募LDB1来稳定PU.1基因调控DNA元件之间所形成的染色质环。
摘要：
基因表达的表观遗传调控发生在被称为拓扑关联域(TADs)的离散空间染色体单元内，但大多数基因的精确的空间要求尚未明确；该点对与癌症相关的基因特别有意义。
Daniel Schuetzmann等人采用高分辨率的染色质构象捕获测序，尝试在健康单核细胞和急性髓系白血病（AML）细胞中绘制编码关键髓系转录因子PU.1的人基因座的三维（3D）结构图。
研究人员确定了一个动态的大约75kb大小的单位（SubTAD）作为基因组区域，该区域内PU.1基因调控元件之间的空间互作发生在髓系分化过程中，并在AML中被破坏。在该SubTAD内，空间染色质互作的合理启动需要PU.1自动调控以及招募染色质衔接蛋白LDB1（LIM结构域结合蛋白1）。但是，这些空间互作一旦发生，LDB1就可不依赖PU.1自动调节而稳定它们。
因此，研究人员得出结论，PU.1通过启动稳定的染色质环，以“打了就跑”的方式自动调节其表达，从而形成转录活跃的染色质结构。
原始出处：
Daniel Schuetzmann，et al. Temporal auto-regulation during human PU.1 locus SubTAD formation. Blood 2018 ：blood-2018-02-834721； doi： https：//doi.org/10.1182/blood-2018-02-834721
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