Blood：DNA甲基化谱鉴别两种巨球蛋白血症 (WM)亚型
2020-06-01 QQY MedSci原创
使用具有记忆和浆细胞样特征的整体DNA甲基化模式可自然地将WM患者分成两个不同的组。 WM甲基化亚型表现出明显的肿瘤特异性分子、形态学、遗传学和表型特征和途径。
B细胞分化过程中的表观遗传变化产生了B细胞亚群特有的DNA甲基化特征，包括记忆B细胞(MBCs)和浆细胞(PCs)。Waldenstrom巨球蛋白血症 (WM)是一种复杂的B细胞恶性肿瘤，由淋巴细胞和浆细胞表型独特地混合组成。
在本研究中，Weil等整合了来自35例MYD88突变型WM患者肿瘤细胞的全基因组DNA甲基化、转录组、突变和其他表型特征；这些特征与正常血浆和B细胞亚群相关。
研究发现根据DNA甲基化谱可将WM患者自然地分成两个组，与正常的MBC和PC相关，并使人联想到其他记忆和浆细胞来源的恶性肿瘤。对正常和WM发育过程中的DNA甲基化变化进行同时分析以捕获肿瘤特异性事件，强调了MBC样WM中的增强子区域和PC样WM中的受抑制和异染色质区域的选择性重编程。
MBC样WM低甲基化在PU1、TCF3和OCT2转录因子的模体中富集，与MYD88/TLR通路活性升高有关。PC样WM表现出明显的整体低甲基化和组蛋白基因的选择性过表达。最后，WM亚型表现出不同的遗传、表型和临床特征。
MBC样WM携带明显更多的克隆性CXCR4突变、13q缺失、脾肿大和血小板减少症；而PC样WM携带更多的6q缺失、6p扩增、IGHV3基因频率增加、CD38表面表达和浆细胞分化特征。
综上所述，本研究阐明了一种利用DNA甲基化模式对WM患者进行亚分类的新方法，并揭示了WM患者之间不同的分子特征。
原始出处：
Damien Roos-Weil，et al.Identification of two DNA methylation subtypes of Waldenstrum's macroglobulinemia with plasma and memory B cell features .May 26，2020
作者：QQY
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