LncRNA与铁死亡，11.8分的文章套路给你总结好了！

近几年，长链非编码RNA（LncRNA）已成为科研领域瞩目的研究热点，对应的研究亦发表在多种高水平杂志上，目前LncRNA的文章数量逐年上升，研究模式也逐渐完善。铁死亡可以说是老生常谈了，这两个热点联系在一起能够发表在11分+水平的杂志，今天就为大家解读这篇文章。

一、研究背景

腹膜转移（PM）是胃癌（GC）远处转移的主要部位，预后和生存率极差。缺氧是腹膜转移的共同特征，缺氧诱导因子 1 α (HIF-1α) 的上调可能是 PM 发生的潜在驱动因素。铁死亡是最近发现的一种受调控的细胞死亡形式，与肿瘤的发生和发展密切相关。然而，将 HIF-1α 与 GC 的 PM 中的铁死亡联系起来的潜在机制仍然未知。作者研究了PM中差异表达的lncRNA, 并研究其具体功能，为 GC 中 PM 的潜在诊断生物标志物和治疗靶点提供了理论支持。

二、研究方法及结果

样本来源：胃腺癌患者样本

动物实验：慢病毒感染细胞，注射到小鼠体内构建肿瘤模型。

细胞实验：GES-1 和 GC 细胞系

生物信息分析：LncRNA microarrays 、 lncRNA 文库构建/lncRNA-seq

功能以及机制验证实验：免疫组化、透射电镜、免疫荧光、FISH、RIP、CHIP、质谱分析、RNA pull-down、mRNA稳定性分析、Lipid ROS assays、Iron assays、 Cell proliferation、 GSH/GSSG、cell viability measurement、Dual-luciferase assays、RT-qPCR、Western Blot

Figure1：首先作者分析的是，胃癌中远端腹膜转移的细胞中HIF-1α的表达。因为缺氧是腹膜转移的驱动因素，所以分析了一下是否会有缺氧诱导因子被激活，然后验证腹膜转移的胃癌细胞中高表达的LncRNA（命名为PMAN）并确认了其与HIF1α的表达相关性。

Figure2：作者阐明了HIF-1α激活PMAN的机制，进一步应用生物信息学分析PMAN的启动子上的HIF1α转录结合位点。证实 HIF-1α 与 PMAN 启动子内源性 HRE 位点的直接结合，进一步说明了HIF-1α可以在缺氧期间在转录水平上诱导PMAN。（经典研究思路）

Figure 3：推测由 HIF-1α 激活的 PMAN 参与了铁死亡，通过敲低过表达PMAN观察肿瘤细胞的铁死亡表型，发现PMAN 可抑制 GC 细胞中的铁死亡。（引入研究热点）

Figure 4-5：验证LncRNA的功能与铁死亡之间的关系。对铁死亡相关的几个基因，在PMAN过表达及敲减的条件下，进行了表达的分析，发现肿瘤中SLC7A11的表达量会增加，特别是腹膜转移的肿瘤细胞，SLC7A11表达也升高。接着作者继续分析PMAN 调控 SLC7A11 的机制，发现发现SLC7A11的蛋白并没有受到PMAN的影响，而PMAN能维持SLC7A11的mRNA稳定性。由于lncRNA 通常通过与RNA Binding Protein (RBP) 结合来发挥其调节功能PMAN于是他们找到了ELAVL1这个蛋白，并且发现PMAN过表达会导致ELAVL1的胞质易位。

Figure 6-7：详细研究ELAVL1通过维持SLC7A11的mRNA稳定性，抑制肿瘤细铁死亡的机制。（热点：表观遗传）

Figure 9：应用于临床诊断与检测，提高意义。上面这些验证，把“缺氧环境→HIF1α激活→PMAN转录→ELAVL1胞质易位→SLC7A11mRNA稳定性提高”串联起来了。接着他们做了体内验证，来证明PMAN对于肿瘤的影响，证明 PMAN 在体内促进肿瘤的发生和发展。

三、总结

在缺氧条件下，HIF-1α 可以作为 GC 细胞中铁死亡的保护因子。HIF-1α 在转录水平激活 PMAN，从而大大提高了 ELAVL1 在细胞质中的输出。ELAVL1直接与SLC7A11 mRNA 3'-UTR的AREs结合，提高SLC7A11 mRNA的稳定性，从而增加SLC7A11的表达，减少铁死亡过程中ROS和铁的积累，最终促进肿瘤细胞的增殖和发展。

来源：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2213231722000842 via%3Dihub

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